124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4112 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  100 
 
 		 296 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  100 
 
 		 296 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  60.75 
 
 		 295 aa  345  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  60.75 
 
 		 295 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  60.75 
 
 		 295 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  59.09 
 
 		 307 aa  324  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  58.62 
 
 		 299 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  59.52 
 
 		 293 aa  322  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  62.86 
 
 		 293 aa  319  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  59.73 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  59.73 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  59.73 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  46.1 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  46.55 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  39.86 
 
 		 288 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  37.76 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  39.18 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  37.33 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  39.18 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  35.27 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  36.43 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  36.43 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  36.3 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  33.22 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.08 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  32.46 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  31.62 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  35.06 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  27.66 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  32.93 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  30.2 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  26.99 
 
 		 313 aa  89.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  34 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  30.83 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  32.93 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.19 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  29.45 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  25.09 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  22.9 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  25.34 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  26.24 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  30.86 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  24.83 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  29.89 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.65 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.79 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  28.63 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  25.99 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  24.83 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  29.35 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  25.74 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  26.62 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.76 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  28.7 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  28.15 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  29.51 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.63 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  28.05 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  22.7 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  22.7 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  25.58 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  26.7 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  24.51 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  24.2 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  30.61 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  25.11 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  24.73 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  31.49 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  24.55 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  33.63 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  44.12 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.03 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.76 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  25.98 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  21.99 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  44.78 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  35.38 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  29.63 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  23.45 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  24.56 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7262  NmrA family protein  32.81 
 
 		 130 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  37.31 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  26.72 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  28.41 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  30.33 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  27.56 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  27.05 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  24.38 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  43.55 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  24.91 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.19 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.38 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  29.07 
 
 		 276 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  25.27 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  43.66 
 
 		 226 aa  45.8  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  26.14 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  32.26 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  27.64 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.51 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>