More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7197 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  100 
 
 		 285 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  40.14 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  40 
 
 		 279 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  37.63 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  39.93 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  38.46 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  37.06 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  33.8 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  33.8 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  36.46 
 
 		 584 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  34.03 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  33.69 
 
 		 271 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  33.22 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  36.3 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  35.86 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  33.92 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  35.46 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  35.56 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  33.45 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  34.39 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  34.15 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  36.49 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  32.73 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  35.29 
 
 		 279 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  37.99 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  33.79 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  33.22 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  33.69 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  32.39 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  31.94 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  33.1 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  32.99 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.38 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  33.45 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  32.87 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.17 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  30.66 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  33.9 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  33.75 
 
 		 240 aa  95.5  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  33.56 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  29.07 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  32.76 
 
 		 295 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  27.24 
 
 		 292 aa  92.8  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  30.22 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  26.22 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  32.29 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.47 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  36.84 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  32.63 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  28.03 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  31.27 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  33.04 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  31.64 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  35.25 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  31.72 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  29.06 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  36.28 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  30.47 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  28.97 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  33.67 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  30.85 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  29.68 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  26.06 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  32.31 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  31.82 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  30.71 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.49 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  28.52 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  34.93 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  36.1 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  24.8 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  25.54 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  33.63 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  31.97 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.05 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  31.31 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  31.58 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  28.75 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  29.12 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  29.37 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  31.67 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  31.67 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  32.55 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  33.09 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  32.16 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  27.97 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  35.53 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  35.53 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  29.71 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  34.15 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  29.21 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  33.17 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  30.97 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  27.3 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  27.18 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  31.41 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  32.16 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  31.11 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  31.11 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  34.01 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>