More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1360 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  100 
 
 
288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  48.42 
 
 
287 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  45.07 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  40.85 
 
 
272 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  38.08 
 
 
584 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  39.02 
 
 
281 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  40 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  36.3 
 
 
279 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  35.29 
 
 
284 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  35.59 
 
 
286 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  32.17 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  35.27 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  34.14 
 
 
273 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  32.87 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  33.92 
 
 
274 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  38.89 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  34.88 
 
 
271 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  34.98 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  32.65 
 
 
274 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  34.04 
 
 
279 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  37.16 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  36.17 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  32.16 
 
 
268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  35.34 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.74 
 
 
281 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  35.15 
 
 
280 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  33.57 
 
 
283 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  39.13 
 
 
240 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  34.28 
 
 
281 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  33.11 
 
 
310 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  33.91 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  33.33 
 
 
291 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  35.54 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  38.7 
 
 
289 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  33.79 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  34.04 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  33.1 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  35.74 
 
 
280 aa  96.3  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  34.01 
 
 
296 aa  92  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  33.72 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  31.38 
 
 
276 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  31.67 
 
 
277 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  35.89 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  31.31 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  30.25 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  26.32 
 
 
273 aa  89  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.77 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  34.12 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  37.23 
 
 
290 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  29.93 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  28.35 
 
 
294 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  36.8 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  33.1 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  32.19 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.61 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  32.49 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  30.03 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  30.77 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  32.49 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  33.21 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  28.23 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  32.76 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  33.11 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  32.76 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  32 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  32.75 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  29.97 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  30.29 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  29.47 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  31.29 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  28.82 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  28.76 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  32.51 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  29.11 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  31.01 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  30.23 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  29.41 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  32.51 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  28.33 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00992  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01860)  26.95 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.961582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  31.91 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  30.66 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  33.68 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  33.48 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  31.16 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  29.7 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  28.17 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  25.52 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.6 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  29.61 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  29.23 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  27.82 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  31.49 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  31.8 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  28.36 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.34 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  29.71 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  30.53 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  28.81 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  32 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>