More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1828 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  100 
 
 		 293 aa  598  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  52.74 
 
 		 292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  48.81 
 
 		 292 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  51.9 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1765  NmrA-like  34.17 
 
 		 366 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0815614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.56 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  30.69 
 
 		 330 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  26.74 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  30.61 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5633  NmrA family protein  31.3 
 
 		 320 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5254  NmrA-like protein  31.68 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5343  NmrA family protein  31.68 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663839  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  31.49 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  29.69 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  29.9 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  30.69 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.82 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.35 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  28.18 
 
 		 584 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  28.83 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  28.42 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.82 
 
 		 282 aa  86.3  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  27.85 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  29.61 
 
 		 285 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.37 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  31.69 
 
 		 290 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  28.47 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  30.22 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  26.21 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  31.28 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6173  hypothetical protein  48.96 
 
 		 123 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0933195  decreased coverage  0.000759145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  29.67 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  29.59 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  31.77 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24.65 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  30.71 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  28.99 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  31.22 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  28.57 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  28.57 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.77 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  30.22 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  27.53 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  27.34 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  27.34 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  24.83 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  28.34 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  26.14 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  26 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  28.27 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  23.68 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  28.33 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  27.12 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  27.37 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  27.36 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  22.43 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5373  NmrA family protein  25.53 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  30.5 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  26.77 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  27.11 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  27.74 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  25.84 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  27.53 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.39 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  27.96 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  25.52 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  28.06 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  26.87 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  26.51 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  28.87 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  28.47 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  26.8 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  26.64 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  26.03 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  27.62 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  29.73 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  29.31 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  30.64 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  29.88 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.32 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  25.31 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  25.77 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  29.02 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  29.6 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  26.98 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  25.71 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  28.21 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  26.28 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  29.24 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  26.35 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  29.29 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  28.98 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  28.62 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  27.5 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  25.32 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>