More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4346 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  100 
 
 		 292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  76.29 
 
 		 292 aa  477  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  52.74 
 
 		 293 aa  298  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  50 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1765  NmrA-like  39.15 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0815614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  29.79 
 
 		 330 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.82 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  32.41 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  31.51 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  27.35 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  31.53 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  29.9 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.72 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  31.36 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5633  NmrA family protein  28.47 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5254  NmrA-like protein  28.81 
 
 		 320 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5343  NmrA family protein  28.81 
 
 		 320 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663839  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  30.1 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6173  hypothetical protein  51.02 
 
 		 123 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0933195  decreased coverage  0.000759145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  28.47 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.42 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  30.03 
 
 		 284 aa  89  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  30.93 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.89 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  31.06 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  29.82 
 
 		 584 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.05 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  28.62 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.08 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  28.16 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  26.9 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  26.83 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  26.98 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  31.28 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  26.62 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  33.2 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  28.28 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  27.53 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  28.04 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  27.46 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  26.33 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  29.51 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  25.91 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  28.33 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.24 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  27.08 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47077  predicted protein  24.14 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0255918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24.83 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  27.27 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.24 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.82 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.47 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  23.47 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  30.04 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  24.65 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  30 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  30 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  29.39 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  26.33 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  32.64 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  26.13 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  28.47 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  27.23 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  30.3 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  28.57 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  27.98 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  30.1 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  30.2 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.78 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  25.32 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  25.99 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  24.86 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  29.53 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  25.79 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  32.14 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  26.5 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  26.55 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  30.47 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  25.27 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  26.48 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  25.89 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  26.51 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  28.77 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  26.46 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  26.27 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  27.09 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  29.96 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5373  NmrA family protein  26.26 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  23.02 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  28.16 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  26.55 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  27.47 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.57 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  23.29 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>