More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0817 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  100 
 
 
289 aa  584  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  78.21 
 
 
290 aa  454  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  78.21 
 
 
290 aa  454  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  73.01 
 
 
293 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  72.08 
 
 
287 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  71.73 
 
 
287 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  71.73 
 
 
287 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  69.61 
 
 
287 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  69.26 
 
 
287 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  59.23 
 
 
289 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  58.48 
 
 
289 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  55.36 
 
 
293 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  54.58 
 
 
292 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  52.48 
 
 
281 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  34.02 
 
 
295 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  31.13 
 
 
289 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  34.03 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  33.57 
 
 
584 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  33.68 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  36.77 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  34.14 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  30.51 
 
 
284 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  37.23 
 
 
293 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  31.79 
 
 
287 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  33.79 
 
 
281 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.78 
 
 
274 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  40.38 
 
 
240 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.39 
 
 
288 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  32.18 
 
 
280 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  29.82 
 
 
292 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  32.49 
 
 
273 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  33.33 
 
 
284 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  30.58 
 
 
273 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.79 
 
 
281 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  39.41 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  31.54 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.31 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  31.94 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  30.18 
 
 
268 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  36.12 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  33.63 
 
 
271 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  32.76 
 
 
281 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  44.68 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  33.78 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  35.5 
 
 
290 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  33.2 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  33.22 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  32.7 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.15 
 
 
320 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  31.76 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  36.96 
 
 
288 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  30.18 
 
 
434 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.7 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  31.27 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  30.43 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  31.12 
 
 
279 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  31.62 
 
 
300 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.44 
 
 
237 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.57 
 
 
320 aa  85.9  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  30.62 
 
 
327 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  29.93 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  31.46 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  30.74 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  30.94 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  26.99 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.14 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  29.63 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  32 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  30 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  38.26 
 
 
298 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  28.81 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.28 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.63 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  34.36 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  31.43 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  32.64 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  27.91 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  27.91 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.47 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.11 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  29.07 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  29.07 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  28.46 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  39.04 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.56 
 
 
320 aa  82  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  33.04 
 
 
292 aa  82  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.65 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  33 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  36.65 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  36.73 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  29.02 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  29.8 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  38.71 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.56 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  29.59 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  27.12 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  38.51 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  31.05 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  28.91 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>