More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2683 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  100 
 
 		 304 aa  582  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  64.73 
 
 		 301 aa  321  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  52.48 
 
 		 286 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  56.89 
 
 		 276 aa  255  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  52.45 
 
 		 282 aa  244  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  51.43 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  49.12 
 
 		 288 aa  231  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  51.02 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  52.01 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  45.33 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4570  NmrA family protein  55.74 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  40.43 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  32.53 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.52 
 
 		 283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  36.76 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  34.72 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  36.33 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  36.03 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  34.26 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  35 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  34.36 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  34.8 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  31.69 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  39.65 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  31.34 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  31.34 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  33.79 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  31.69 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  33.81 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  38.11 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  27.65 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  35.81 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  31.58 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  36.2 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  30.5 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  30.96 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  30.96 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  33.67 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  30.6 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  30.99 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  30.25 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  33.48 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  34.52 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  30.25 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  30.25 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  30.6 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  36.33 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  31.91 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  34.13 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1180  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.46 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  32.6 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  31.93 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  30.25 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  31.49 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  31.39 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  35.71 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  34.01 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  35.82 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  32.64 
 
 		 282 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  31.86 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  27.76 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  32.64 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  30.17 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  30.67 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  35.46 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  31.4 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  32.78 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  29.31 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  30.04 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  32.4 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  34.88 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  39.8 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  33.22 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.31 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.89 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  31.54 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  32.03 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  33.94 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.7 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  27.18 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  31.36 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.03 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.25 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  29.45 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  36.44 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  31.79 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  36.71 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.04 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  30 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  33.11 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  31.58 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  33.45 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  31.08 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  30.22 
 
 		 281 aa  85.5  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  32.39 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  32.04 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  31 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0550335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>