More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3747 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  100 
 
 
284 aa  569  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  70.5 
 
 
286 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  58.03 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  54.84 
 
 
288 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  54.41 
 
 
276 aa  239  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  51.43 
 
 
304 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  50.89 
 
 
301 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  46.57 
 
 
297 aa  222  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  43.8 
 
 
311 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  47.86 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4570  NmrA family protein  48.28 
 
 
358 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  38.16 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.1 
 
 
283 aa  119  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  38.81 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  31.47 
 
 
291 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  37.93 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  33.78 
 
 
283 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  34.67 
 
 
283 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  31.71 
 
 
283 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  27.37 
 
 
288 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  31.91 
 
 
283 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  27.72 
 
 
288 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  31.99 
 
 
271 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  36.44 
 
 
284 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  31.91 
 
 
287 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  30.18 
 
 
287 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  28.42 
 
 
292 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  34.23 
 
 
286 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  34.23 
 
 
286 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  34.23 
 
 
286 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  34.39 
 
 
286 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  34.39 
 
 
286 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  29.43 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  31.36 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  34.68 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  34.23 
 
 
286 aa  99  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  34.23 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  35.5 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1070  NmrA family protein  32.5 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  33.33 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  30.15 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  34.23 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  34.31 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  32.86 
 
 
284 aa  95.9  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  30.11 
 
 
287 aa  95.5  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  28.47 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1180  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.39 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  34.07 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.68 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  32.43 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  30.45 
 
 
285 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  28.72 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  32.73 
 
 
280 aa  92.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.01 
 
 
284 aa  92.8  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  32.43 
 
 
282 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  31.98 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  31.98 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  29.64 
 
 
285 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  31.84 
 
 
285 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  32 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  34.84 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  31.84 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  30.94 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  27.27 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  27.27 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  33.33 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  32.74 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  31.21 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  31.53 
 
 
282 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0182  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.87 
 
 
284 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  31.72 
 
 
351 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  34.23 
 
 
285 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  25.09 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  31.43 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  34.36 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.95 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  31.95 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  32.03 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  30.07 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  28.47 
 
 
294 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  34.19 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  27.78 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  31.67 
 
 
281 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  35.53 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  33.7 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  25.35 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.88 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  32.03 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  27.89 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  31.08 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  32.33 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  28.98 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  29.68 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  33.04 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  26.45 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  29.02 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  34.54 
 
 
282 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  34.98 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>