207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1180 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1180  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 293 aa  557  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5824  NmrA family protein  55.44 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2868  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  54.05 
 
 		 188 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.288118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.08 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  34.12 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  39.1 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  33.66 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  34.14 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  32.01 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.67 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  36.69 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  34.81 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  30.58 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  31.86 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  37.04 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  34.46 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2870  hypothetical protein  56.07 
 
 		 142 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  32.62 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  30.72 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  34.39 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  34.13 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  32.54 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  34.67 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  34.67 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  35.64 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  31.37 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  33.22 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  25.73 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  35.64 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  32.59 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  32.89 
 
 		 281 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  31.03 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  32 
 
 		 282 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  29.87 
 
 		 287 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  34.66 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  32.94 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.32 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  32.76 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  33.89 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  36.67 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  34.78 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  29.17 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  35.69 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24.05 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  32.66 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  32.2 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  33.88 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1070  NmrA family protein  32.51 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  38.19 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  30.8 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  34.52 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  35.8 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  31.52 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  32.14 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  34.52 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  29.9 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  34.52 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  34.52 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  32.88 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  33.11 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0277  NmrA-like  33.22 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  28.18 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  33.22 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  34.13 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  35.69 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  33.73 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  30.24 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  23.57 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  30.45 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  30.1 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  34.13 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  34.13 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  32.89 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  33.72 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  29.35 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  31.88 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  35.69 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  33.07 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  33.73 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  33.07 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  33.22 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  32.08 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  32.94 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  32.18 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  32.68 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  32.77 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  32.68 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  28.14 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  31.62 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  32.68 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  35.69 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  33.07 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  30.1 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  34 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  31.03 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  25.25 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.21 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>