67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2870 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2870  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1180  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  56.07 
 
 		 293 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5824  NmrA family protein  55.34 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  36.94 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  35.51 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  36.36 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.11 
 
 		 284 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  35.14 
 
 		 285 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 285 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 285 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  38.84 
 
 		 284 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  35.78 
 
 		 280 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01841  NmrA-like family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02840)  33.64 
 
 		 306 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.972262 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  40.54 
 
 		 303 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  36.13 
 
 		 289 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  36.45 
 
 		 285 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  39.45 
 
 		 284 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  34.51 
 
 		 294 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  39.64 
 
 		 271 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  33.33 
 
 		 281 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  31.3 
 
 		 289 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  30.84 
 
 		 288 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  37.39 
 
 		 284 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  34.91 
 
 		 297 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  36.52 
 
 		 284 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0617  NmrA family protein  41.07 
 
 		 298 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  33.93 
 
 		 284 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  36.52 
 
 		 284 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  38.74 
 
 		 285 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  34.55 
 
 		 291 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  37.96 
 
 		 290 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  37.5 
 
 		 284 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  32.14 
 
 		 295 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.54 
 
 		 283 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1918  NmrA family protein  36.19 
 
 		 292 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.838838  normal  0.442716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  31.53 
 
 		 294 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  35.9 
 
 		 291 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  33.02 
 
 		 297 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  35.19 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  33.94 
 
 		 294 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  34.82 
 
 		 283 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  33.33 
 
 		 283 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  35.19 
 
 		 293 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  35.19 
 
 		 285 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  31.3 
 
 		 288 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09322  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G03450)  36.84 
 
 		 316 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133356  normal  0.645276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  36.19 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  32.43 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  36.94 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  32.43 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  37.17 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  33.33 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  31.53 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  32.43 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  31.53 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1880  hypothetical protein  30.84 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  33.33 
 
 		 287 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  39.5 
 
 		 301 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  36.28 
 
 		 289 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  34.86 
 
 		 279 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  31.75 
 
 		 285 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03749  oxidoreductase  34.21 
 
 		 286 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 250 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 478 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  34.51 
 
 		 283 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  34.55 
 
 		 305 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>