204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5824 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5824  NmrA family protein  100 
 
 		 303 aa  590  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1180  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  54.95 
 
 		 293 aa  278  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2868  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  49.43 
 
 		 188 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.288118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.1 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  35.4 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  35.17 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  34.25 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  33.07 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  32.55 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  30.2 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  32.68 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  34.9 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  33.73 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  35.23 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2870  hypothetical protein  55.34 
 
 		 142 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  33.59 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  33.47 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  34.92 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  32.86 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  35.19 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  27.4 
 
 		 289 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  30.51 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  31.23 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  30.61 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.67 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  31.23 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  31.23 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  34.11 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  30.85 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  35.94 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  32.11 
 
 		 271 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  31.37 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  35.74 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  35.25 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  32.41 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  34.23 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  33.85 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  30.43 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  34.68 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  30.04 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  29.64 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24.73 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  30.43 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  33.98 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  28.38 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  33.47 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  28.68 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  29.84 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  30.61 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  35.57 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  33.47 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  30.61 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  30.95 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  29.25 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  29.25 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  31.02 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  29.93 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  31.27 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.57 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  31.95 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  34.45 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  30.24 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  30.27 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03749  oxidoreductase  33.1 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  31.38 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.43 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  33.76 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  30 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  27.03 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  31.37 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  25.25 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  27.17 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  29.62 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  29.62 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  31.48 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  27.91 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  30.22 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  31.48 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0617  NmrA family protein  33.73 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  31.33 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  26.62 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  28.95 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.07 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  32.88 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  31.91 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  31.22 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09322  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G03450)  27.19 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133356  normal  0.645276 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01841  NmrA-like family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02840)  24.41 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.972262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  24.75 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  32.49 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  28.15 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  34.1 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  27.18 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  27.74 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  28.67 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2475  hypothetical protein  31.61 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0316399  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  30.4 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  27.76 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>