111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2868 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2868  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 188 aa  360  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.288118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1180  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  54.05 
 
 		 293 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5824  NmrA family protein  49.43 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  38.89 
 
 		 294 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.98 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  33.91 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  36.16 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  31.69 
 
 		 284 aa  65.1  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.76 
 
 		 282 aa  64.7  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  32.17 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  32.75 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  37.41 
 
 		 297 aa  62  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  28.74 
 
 		 292 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  32.9 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  32.79 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  35.2 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  34.55 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  33.54 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  28.89 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  33.33 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  28.17 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  32.09 
 
 		 351 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.1 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  34.3 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  37.68 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  36.96 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  32.57 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  35.97 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  36.96 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  36.96 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  36.96 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  36.96 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  36.96 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  36.96 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  34.53 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  36.96 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  26.47 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  34.53 
 
 		 285 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  33.59 
 
 		 277 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  37.14 
 
 		 294 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  30.43 
 
 		 283 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  33.33 
 
 		 284 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  29.71 
 
 		 283 aa  52  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  32.74 
 
 		 288 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  34.65 
 
 		 276 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  32.32 
 
 		 278 aa  51.6  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1765  NmrA-like  30.56 
 
 		 366 aa  51.6  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0815614  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  38.85 
 
 		 288 aa  51.2  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  34.15 
 
 		 285 aa  51.2  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  32.48 
 
 		 285 aa  51.2  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  37.5 
 
 		 298 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  35.12 
 
 		 288 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  31.34 
 
 		 305 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  37.59 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  31.18 
 
 		 289 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  34.78 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  33.7 
 
 		 281 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  34.78 
 
 		 282 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  34.78 
 
 		 282 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  31.21 
 
 		 299 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  34.43 
 
 		 283 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  34.78 
 
 		 282 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  31.07 
 
 		 301 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  35.07 
 
 		 282 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  29.03 
 
 		 284 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  28.3 
 
 		 287 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  33.33 
 
 		 274 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  27.78 
 
 		 288 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  36.96 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  30.77 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  36.96 
 
 		 289 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  34.51 
 
 		 287 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  37.14 
 
 		 294 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  23.67 
 
 		 273 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  30.22 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  25.44 
 
 		 301 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  29.49 
 
 		 284 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  32.61 
 
 		 282 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  28.49 
 
 		 295 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  32.37 
 
 		 285 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  30.99 
 
 		 285 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  28.57 
 
 		 287 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  29.88 
 
 		 294 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  28.93 
 
 		 294 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  35.51 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  35.51 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  36.96 
 
 		 280 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  28.57 
 
 		 289 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  29.1 
 
 		 291 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4570  NmrA family protein  38.33 
 
 		 358 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  26.82 
 
 		 292 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  27.36 
 
 		 281 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  33.93 
 
 		 293 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  22.5 
 
 		 293 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  37.5 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  32.35 
 
 		 295 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  29.2 
 
 		 281 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.91 
 
 		 292 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>