240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2536 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  100 
 
 
294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  37.71 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  32.53 
 
 
292 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  35.96 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  36.12 
 
 
289 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  34.94 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.58 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  31.4 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  31.51 
 
 
294 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  31.62 
 
 
289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  35.35 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5161  NmrA family protein  34.93 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  30.94 
 
 
319 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  27.78 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  29.67 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  30.18 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  30.18 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  29.25 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  31.9 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  28.87 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  29.27 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  27.05 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  26.71 
 
 
294 aa  85.9  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  26.33 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  31.54 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  31.48 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  26.51 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  26.78 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.1 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  27.82 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  29.96 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  29.49 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  30.15 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  32.89 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  29.62 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  29.72 
 
 
287 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.15 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  29.29 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  29.21 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  25.87 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.61 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  28.96 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  29.44 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.74 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  29.17 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  30.45 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.51 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  30.68 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  29.43 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.86 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.36 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  26.4 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  31.98 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.32 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  29.13 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.27 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  28.18 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  27.89 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  26.59 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  26.92 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  28.91 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  24.72 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  32.14 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  31.3 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  26.67 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  24.72 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  29.3 
 
 
285 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  29.57 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.46 
 
 
274 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.88 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  27.61 
 
 
293 aa  62.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.39 
 
 
274 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  29.13 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  26.19 
 
 
584 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  25.75 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  28.7 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  32.3 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  28.7 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  28.7 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  30.2 
 
 
274 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  20.94 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  31.02 
 
 
288 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  31.02 
 
 
288 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  28.99 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  29.48 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  26.72 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  25.61 
 
 
351 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  29.89 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  23.79 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  27.99 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  24.37 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  27.94 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  30.85 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  29.74 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  25.3 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  28.29 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  25.93 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  29.21 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.63 
 
 
282 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>