182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4046 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  100 
 
 
289 aa  565  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  54.67 
 
 
289 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  49.83 
 
 
289 aa  252  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  45.17 
 
 
292 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  29.79 
 
 
294 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  28.98 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  31.62 
 
 
294 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  31.65 
 
 
297 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  28.72 
 
 
312 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  29 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  29.27 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  33.1 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  29.3 
 
 
319 aa  87  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5161  NmrA family protein  30.74 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  30.66 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  26.84 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  31.05 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  30.17 
 
 
285 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  27.11 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  29.03 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  29.6 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  26.86 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  27.17 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  31 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  25.44 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  27.48 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  30.99 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  28.69 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  31.02 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  23.79 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  30.65 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  30.4 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  32.13 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  30.49 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.99 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  30.26 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  31.98 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  29.48 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  28.63 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  28.46 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  27.74 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  32.79 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  32.27 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  32.79 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  32.02 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  29.08 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  28.06 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  30.92 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  31.76 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  31.76 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  29.1 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  31.69 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.26 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  31.08 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28.07 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.66 
 
 
271 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.26 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  29.84 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  25.09 
 
 
296 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  28.07 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.27 
 
 
312 aa  59.3  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  27.97 
 
 
351 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  30.5 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  23.93 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  27.31 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  30.24 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  30.08 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  31.05 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  32.74 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  31.4 
 
 
276 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  32.47 
 
 
297 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  26.26 
 
 
283 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  31.03 
 
 
281 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  23.28 
 
 
273 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  23.28 
 
 
273 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  22.92 
 
 
273 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  28.57 
 
 
294 aa  55.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  29.51 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  27.03 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  29.55 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  29.51 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  26.51 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  27.03 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  37.14 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.83 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  28.35 
 
 
273 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  25.1 
 
 
311 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  28.81 
 
 
280 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  29.1 
 
 
280 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  29.2 
 
 
289 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  29.17 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  25.83 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  28.74 
 
 
277 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  33.16 
 
 
307 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  26.22 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  29.71 
 
 
279 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  30.6 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.38 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>