295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5084 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  100 
 
 		 294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5161  NmrA family protein  51.37 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  47.3 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  30.1 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  27.3 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  29.79 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.29 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  31.62 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  31.51 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  29.35 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  25.34 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  28.46 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  27.78 
 
 		 584 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.11 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  27.59 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  30.15 
 
 		 287 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  26.99 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  27.44 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.22 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  30.2 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.52 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  31.36 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28.46 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  26.88 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  27.84 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  30.12 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  30.12 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  29.73 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  27.1 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.47 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  26.89 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  23.18 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  25.88 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  28.35 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  28.63 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  26.47 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  26.39 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  27.15 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  25.39 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  27.27 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  25.33 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  26.59 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  26.34 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.81 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  25.51 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  24.07 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  27.9 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  26.37 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  28.02 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  26.23 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.71 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  27.8 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  27.8 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  27.24 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  26.25 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  24.58 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  23.05 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  25.91 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  25.77 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.02 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  26 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  23.96 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  27.71 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.59 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  28.46 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  26.19 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  27.41 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  25.42 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  24.12 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  30.45 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  27.34 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  23.25 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  28.4 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  24.91 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  24.67 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  27.31 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  28.74 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  26.29 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  26.5 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47077  predicted protein  22.41 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0255918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17190  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  45.83 
 
 		 491 aa  59.7  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  24.51 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  22.96 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  24.11 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  25 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  24.57 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  25.09 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  25.17 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  25.9 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  25.42 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1172  NmrA family protein  28.39 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37667  predicted protein  22.65 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.658602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  23.6 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  23.53 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  23.7 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  24.61 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  25.86 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>