261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6315 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  100 
 
 		 312 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  59.93 
 
 		 290 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  35.49 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  34.26 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  32.56 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  34.14 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  28.37 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  28.77 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  30.07 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  28.22 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  29.22 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  31.08 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  28.69 
 
 		 287 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  27.34 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  29.39 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  28.72 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  29.05 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  27.97 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  27.97 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  30.61 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  30.61 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.11 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  27.56 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  27 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  27.24 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  31.56 
 
 		 285 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  28.34 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  24.74 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  27.14 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  28.78 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  24.92 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  27.21 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  28.72 
 
 		 289 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  28.74 
 
 		 293 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  29.01 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  29.01 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  24.65 
 
 		 292 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.82 
 
 		 274 aa  89  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  25.56 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  25.78 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  26.92 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  24.44 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  23.77 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  25.89 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  22.44 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  28.57 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  24.91 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.59 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  22.86 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.07 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.07 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  26.59 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  28.63 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  27.75 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  28 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  23.39 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  27.03 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  24.15 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  23.13 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  22.43 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  26.78 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  25.43 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  24.83 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  24.57 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.9 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  23.25 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1765  NmrA-like  23.89 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0815614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  24.81 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  27.27 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  26.87 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  27.31 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  26.87 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  24.57 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  34.17 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  26.64 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  22.26 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  23.89 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  25.11 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  26.14 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  23.77 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  24.03 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  26.7 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09194  conserved hypothetical protein  26.2 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.947988  normal  0.455195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  21.89 
 
 		 434 aa  59.3  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  26.61 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  25.32 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  21.03 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  25.99 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  24.33 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  25.09 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  22.63 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  25.68 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  21.88 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  26.29 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  25.45 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  23.08 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  25.11 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>