92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4999 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  100 
 
 		 297 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  100 
 
 		 297 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  86.39 
 
 		 295 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  81.63 
 
 		 295 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  81.63 
 
 		 295 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  87.76 
 
 		 316 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  74.64 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  59.73 
 
 		 296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  59.73 
 
 		 296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  58.97 
 
 		 299 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  56.64 
 
 		 307 aa  322  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  54.3 
 
 		 293 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  47.55 
 
 		 300 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  42.27 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  37.67 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.67 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  32.88 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  36.08 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  35.27 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  35.27 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  34.02 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  32.65 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  30.58 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  34.36 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  34.36 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  34.36 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  29.01 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  34.47 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  28.28 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  28.67 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  29.32 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  31.1 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  33.33 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  26.12 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  25.1 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  24.44 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  25.91 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  27.6 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  28.57 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.68 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  24.67 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  26.17 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  24.91 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.48 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  48.53 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  25.95 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  25.09 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  25.86 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  23.28 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  23.57 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  26.79 
 
 		 124 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  25.66 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  24.07 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  23.86 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  22.37 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  27.33 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  28.33 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24.19 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  23.75 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  24.62 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  40 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  43.48 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  26.77 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7262  NmrA family protein  34.4 
 
 		 130 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.36 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  23.57 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  33.33 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.57 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  26.2 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  36.26 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  36.49 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  29.17 
 
 		 223 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  25.18 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  23.87 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  24.26 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  25.48 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  29.36 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  31.68 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  23.74 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 237 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28.06 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  38.46 
 
 		 333 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  21.79 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2749  NmrA family protein  39.71 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>