More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2558 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  100 
 
 		 291 aa  587  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  76.63 
 
 		 291 aa  457  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  73.79 
 
 		 321 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  64.95 
 
 		 291 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  54.42 
 
 		 300 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  34.8 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.94 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.26 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  30.04 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  29.58 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  31.1 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  29.55 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  28.73 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  29.53 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  27.12 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  27.12 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  28.23 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  28.24 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  28.46 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.31 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  28.94 
 
 		 314 aa  98.2  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.36 
 
 		 320 aa  95.5  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  29.41 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  29.08 
 
 		 381 aa  92.4  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  28.12 
 
 		 341 aa  92.4  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.38 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.96 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  27.8 
 
 		 342 aa  89.7  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.8 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.2 
 
 		 320 aa  89  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  37.91 
 
 		 216 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.73 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  25.56 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  25 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  24.53 
 
 		 340 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  30.7 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  27.67 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  28.14 
 
 		 343 aa  85.5  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.38 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  30.41 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.92 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.92 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.17 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.58 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1791  NmrA family protein  30.4 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.15 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  27.51 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  27.75 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  31.02 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  30.8 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3070  hypothetical protein  29.43 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  31.33 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  35.92 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  25.3 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.53 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 		 214 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  25.2 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  27.16 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  29.96 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.44 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  29.44 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387174  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.78 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  24.57 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  27.63 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  30.04 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.76 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  31.17 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  29.34 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  26.16 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  28.88 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  26.79 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  27.35 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  29.96 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>