127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5244 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  100 
 
 
293 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  73.81 
 
 
295 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  73.47 
 
 
295 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  73.13 
 
 
295 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  74.15 
 
 
297 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  74.15 
 
 
297 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  71.77 
 
 
316 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  61.77 
 
 
296 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  61.77 
 
 
296 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  58.28 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  55.17 
 
 
299 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  55.71 
 
 
307 aa  291  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  51.05 
 
 
300 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  45.7 
 
 
292 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.84 
 
 
286 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  32.52 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  30.24 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  33.7 
 
 
288 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  36 
 
 
288 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  35.02 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  35.04 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  34.18 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  34.67 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  34.67 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  32.47 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  30.69 
 
 
285 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  28.74 
 
 
312 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  29.55 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  34.07 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  29.12 
 
 
286 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  30.74 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  29.21 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  34.11 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  34.24 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  23.55 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  29.37 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  23.63 
 
 
292 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  25.37 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  26.96 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  25.95 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  50 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  24.05 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  28 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  25 
 
 
295 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  30.71 
 
 
240 aa  55.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  25.47 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.09 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  23.6 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  25.62 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.04 
 
 
289 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  25.86 
 
 
281 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  24.66 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  36.56 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  27.69 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  29.1 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  24.32 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  24.25 
 
 
271 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
329 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  24.81 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  24.14 
 
 
285 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
329 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
329 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  31.68 
 
 
311 aa  49.3  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  25.77 
 
 
273 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  27.23 
 
 
280 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
320 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  24.77 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  27.03 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  26.28 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  24.14 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  28.63 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.46 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  25.27 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  24.26 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  24.42 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  28.68 
 
 
288 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  27.78 
 
 
307 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  30.16 
 
 
280 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.55 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  25.42 
 
 
292 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  29.73 
 
 
289 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  47.76 
 
 
280 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7262  NmrA family protein  38.71 
 
 
130 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  24.45 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  43.94 
 
 
680 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  47.06 
 
 
305 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  25 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  24.32 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.4 
 
 
271 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  33.85 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  41.94 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.54 
 
 
262 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  41.89 
 
 
450 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  43.86 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>