More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2288 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  100 
 
 		 450 aa  894    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  43.06 
 
 		 290 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  43.77 
 
 		 307 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  39.93 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  38.41 
 
 		 304 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  39.01 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  37.89 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  39.71 
 
 		 290 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  35.22 
 
 		 284 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  36.33 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  38.21 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  36.39 
 
 		 298 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  28.68 
 
 		 273 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  28.68 
 
 		 273 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  38.25 
 
 		 300 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  33.69 
 
 		 300 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  37.72 
 
 		 226 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  34.9 
 
 		 305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  36.33 
 
 		 305 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  30.18 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  33.76 
 
 		 303 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  33.22 
 
 		 306 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.67 
 
 		 316 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  28.67 
 
 		 345 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  32.5 
 
 		 309 aa  89.7  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  26.76 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  31.78 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  28.38 
 
 		 326 aa  89  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  33.1 
 
 		 287 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  33.1 
 
 		 287 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  26.94 
 
 		 311 aa  87.8  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  30.77 
 
 		 312 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  31.43 
 
 		 170 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  30.32 
 
 		 316 aa  87  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  31.38 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  35.64 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  35.79 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  31.35 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  31.35 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  32.69 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  35.68 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  30.16 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  27.36 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  29.12 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 318 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  33.16 
 
 		 293 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  30.22 
 
 		 152 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  34.54 
 
 		 289 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  34.31 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  28.43 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  31.18 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  30.63 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  31.36 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  34.44 
 
 		 295 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  32.43 
 
 		 290 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  35.9 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  30.45 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.33 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  27.38 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  31.82 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  38.41 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  26.46 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  32.44 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  35.66 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  28.95 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  35.46 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  34.04 
 
 		 155 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.19 
 
 		 286 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  33.66 
 
 		 288 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  26.44 
 
 		 317 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  32.9 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  33.17 
 
 		 288 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  34.04 
 
 		 295 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  27.54 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0322  hypothetical protein  33.87 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.753161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  33.63 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.35 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  32.61 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12330  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.98 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  32.11 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  30.36 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  32.74 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  39.35 
 
 		 285 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  30.9 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  35.67 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  33.17 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  30.87 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  30.6 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  36.54 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 285 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.31 
 
 		 328 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  37.74 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.5 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  29.32 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  31.7 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  34.97 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  35.42 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>