127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5710 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  100 
 
 		 292 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  72.03 
 
 		 286 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  48.07 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  48.39 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  34.63 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  32.56 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  36.39 
 
 		 288 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  35.81 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  33.9 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  31.91 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  34.84 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  31.29 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  37.15 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  33.77 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  48.33 
 
 		 124 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.62 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  34.59 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  33.9 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  33.9 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  31.02 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  35.48 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  34 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  34 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  25.44 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  27.69 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  27.82 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  24.82 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  28.77 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  23.53 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  29.69 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  27.7 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  28.78 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  28.74 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  24.31 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  30.42 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  24.33 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  27.76 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  24.66 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  25.88 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5244  NmrA family protein  27.94 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  24.21 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  23.81 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.27 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  31.98 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  23.15 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  25.42 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  26.6 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  26.36 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  21.72 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  26.36 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4317  NmrA-like protein  27.65 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010584 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  26.5 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  29.07 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4999  NmrA-like  26.12 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5861  NmrA family protein  26.12 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  23.66 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.65 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  29.56 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  27.76 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  25.1 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  26.99 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  23.79 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  29.2 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  29.2 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  24.83 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  28.76 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  29.58 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  23.79 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  23.05 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  29.58 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  21.43 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  28.76 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  23.66 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  23.66 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  24.37 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46721  predicted protein  26.51 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.17 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  26.97 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  26.16 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  26.58 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  29.83 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  28.11 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  26.61 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  25.63 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  23.08 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  25.68 
 
 		 289 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  21.88 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  26.96 
 
 		 297 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  23.39 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  21.96 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  28.65 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  24.28 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  26.74 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  26.74 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  25.41 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  24.56 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  29.8 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  25 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5343  NmrA family protein  26.82 
 
 		 320 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663839  normal  0.467747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>