220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3958 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  50.87 
 
 
294 aa  290  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  46.58 
 
 
295 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  53.06 
 
 
296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  46.23 
 
 
292 aa  261  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  45.58 
 
 
296 aa  245  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  45.3 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  45.24 
 
 
295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  40.61 
 
 
319 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  41.61 
 
 
299 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  41.47 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  42.86 
 
 
294 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  38.64 
 
 
297 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  37.7 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  29.66 
 
 
299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0241  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.21 
 
 
292 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  32.71 
 
 
294 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  31.06 
 
 
313 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  27.56 
 
 
312 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  26.59 
 
 
290 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  29.04 
 
 
290 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.57 
 
 
286 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  29.96 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  29.09 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  27.38 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  29 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  30.22 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  27.27 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.57 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.67 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  25.76 
 
 
288 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  26.12 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  25.08 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  25.17 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  25.43 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  25.43 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  25.22 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  26.24 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  26.2 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  25.45 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  24.33 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  26.77 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  26.02 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  27.46 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  28.8 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  27.18 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  24.54 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  26.59 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  28.23 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2677  NmrA family protein  26.67 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  25 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  27.38 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  23.08 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  35.11 
 
 
124 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  24.03 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  22.9 
 
 
296 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  24.9 
 
 
295 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  22.9 
 
 
296 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  22.57 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  27.66 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.22 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  29.44 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  24.9 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  25.6 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  26.91 
 
 
280 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  23.02 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  26.7 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  29.68 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  25.73 
 
 
240 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  29.57 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  25.48 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  30.46 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  27.64 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  24.34 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  28.14 
 
 
289 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  21.08 
 
 
300 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  26.39 
 
 
226 aa  55.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  27.86 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  28.33 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  26.11 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  27.36 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  27.36 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  26.64 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 
411 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  25.3 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  24.83 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  25.49 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  27 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6199  NmrA family protein  22.59 
 
 
300 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.746498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  28.12 
 
 
333 aa  53.1  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  27.23 
 
 
287 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  23.08 
 
 
285 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
209 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  25.53 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.81 
 
 
291 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  26.42 
 
 
309 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
213 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  27.92 
 
 
212 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  23.97 
 
 
584 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>