More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1449 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  100 
 
 
275 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  44 
 
 
584 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  43.42 
 
 
281 aa  188  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  43.62 
 
 
283 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  40.7 
 
 
274 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  40.64 
 
 
271 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  42.07 
 
 
286 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  41.01 
 
 
280 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  40.7 
 
 
274 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  40.28 
 
 
274 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  44.13 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  41.61 
 
 
280 aa  161  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  41.43 
 
 
279 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  36.65 
 
 
273 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  37.63 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  41.96 
 
 
280 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  42.6 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  38.35 
 
 
272 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  36.3 
 
 
274 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  35.56 
 
 
273 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  38.62 
 
 
276 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  35.92 
 
 
284 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  39.65 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  43.04 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  37.23 
 
 
279 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  37.68 
 
 
287 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  39.5 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  38.65 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  36.1 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  34.51 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.59 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.97 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  35.34 
 
 
279 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  37.06 
 
 
310 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  34.69 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  36.69 
 
 
299 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  36.75 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  34.49 
 
 
292 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4330  NmrA family protein  35.07 
 
 
318 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  34.3 
 
 
289 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  32.5 
 
 
351 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  34.78 
 
 
283 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.87 
 
 
295 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  33.1 
 
 
434 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  32.87 
 
 
291 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.61 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  28.03 
 
 
292 aa  99.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  35.39 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  34.51 
 
 
290 aa  99  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  37.77 
 
 
274 aa  98.6  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  34.12 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  41.36 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  34.53 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  33.78 
 
 
302 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  33.8 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  32.71 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  33.8 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  35.81 
 
 
293 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  37.89 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  32.63 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  28.04 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  33.79 
 
 
293 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  36 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  32.86 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  36 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  29.13 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  30.8 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  31.67 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  31.34 
 
 
281 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  33.47 
 
 
294 aa  85.9  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  28.97 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  27.08 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  38.57 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  29.54 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  31.79 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  31.88 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  31.91 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  42.18 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  34.29 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  32.68 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  31.69 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.75 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  33.64 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  30.88 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  32.74 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  31.9 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.05 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  27.8 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  29.21 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.84 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  31.71 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  29.25 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  30.07 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  31.29 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  32.41 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  32.99 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  30.25 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  28.4 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>