299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3216 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  100 
 
 
279 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  88.17 
 
 
279 aa  471  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  63.14 
 
 
294 aa  352  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  61.37 
 
 
278 aa  349  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  58.05 
 
 
291 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  54.48 
 
 
281 aa  299  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  55.07 
 
 
279 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  50.36 
 
 
279 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  48.9 
 
 
276 aa  286  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  54.31 
 
 
274 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  53.08 
 
 
285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  52.63 
 
 
276 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  46.52 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.29 
 
 
276 aa  249  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  47.97 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  45.69 
 
 
272 aa  237  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  53.18 
 
 
274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  53.18 
 
 
274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  51.62 
 
 
279 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  44.72 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  44.48 
 
 
298 aa  218  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  42.2 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  47.94 
 
 
268 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  47.14 
 
 
276 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  42.86 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  43.11 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2405  NmrA family protein  49.07 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  40.5 
 
 
288 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  44.49 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  35.74 
 
 
434 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  35.71 
 
 
280 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  38.93 
 
 
276 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  35.04 
 
 
280 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  35.27 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  35.27 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  31.56 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  35.98 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  34.06 
 
 
284 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  31.65 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  29.64 
 
 
351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  36.17 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  36.52 
 
 
273 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  35.11 
 
 
291 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  35.19 
 
 
275 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  30.56 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  30.28 
 
 
283 aa  99  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  32.71 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.27 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  35.16 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  34.66 
 
 
278 aa  96.3  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  31.41 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  33.94 
 
 
280 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  32.18 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  27.2 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.86 
 
 
271 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  32.39 
 
 
281 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  31.79 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  31.05 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  35.29 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.37 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  34.73 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  33.47 
 
 
584 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  29.45 
 
 
281 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  31.03 
 
 
279 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  29.69 
 
 
292 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.53 
 
 
292 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  31.6 
 
 
279 aa  85.5  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.27 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.79 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  31.21 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  28.67 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  28.48 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.45 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  25.34 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  28.97 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  28.57 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  34.01 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1166  hypothetical protein  28.71 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22916  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  27.6 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  31.54 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  29.51 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  29.02 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  36.78 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  27.37 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  29.55 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  35.27 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  31.72 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  31.63 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  25.68 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  32.64 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  34 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  25.61 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  31.88 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  27.64 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  28.05 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  29.66 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  28.78 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  26.62 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  33.33 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>