275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2984 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  100 
 
 
291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  48.71 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  48.71 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  46.62 
 
 
280 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  45.22 
 
 
304 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  41.94 
 
 
281 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  38.71 
 
 
291 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  37.05 
 
 
299 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  35.74 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  35.05 
 
 
287 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  32.36 
 
 
351 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  36.17 
 
 
276 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  41.01 
 
 
276 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  37.28 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  34.15 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  35.11 
 
 
434 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  34.78 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  35.46 
 
 
285 aa  125  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  27.05 
 
 
273 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  34.72 
 
 
294 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.45 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  34.74 
 
 
279 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  38.13 
 
 
283 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  34.64 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  29.97 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  35.11 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  26.57 
 
 
276 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  33.33 
 
 
279 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  34.27 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  34.97 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  29.79 
 
 
281 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  35.09 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  34.72 
 
 
288 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  30.96 
 
 
272 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  30.41 
 
 
285 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  30.8 
 
 
277 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  33.22 
 
 
281 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  36.68 
 
 
279 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  29.71 
 
 
277 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  33.22 
 
 
279 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  35 
 
 
276 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
276 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.1 
 
 
274 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  32.75 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  32.98 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  36.14 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  31.42 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.45 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  33.22 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  29.79 
 
 
283 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  30.34 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  32.86 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  33 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  30.72 
 
 
285 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  31.62 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  27.4 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  28.62 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  34.38 
 
 
280 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  35.66 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  35.66 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  30.32 
 
 
285 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  27.34 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  32.87 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  32.03 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  31.23 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  31.38 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  25.84 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.82 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1166  hypothetical protein  29.41 
 
 
207 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22916  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.48 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  32.87 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  31.23 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  29.5 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  26.26 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  31.27 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  35.65 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  28.99 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  30.74 
 
 
584 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  38.57 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  30.85 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  29.17 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  34.11 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  32.78 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  29.11 
 
 
274 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  28.94 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  24.31 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  31.34 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.47 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.47 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.58 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  29.54 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  30.88 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  32.13 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  31.06 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  31.62 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  27.44 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2405  NmrA family protein  34.05 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  30.29 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  27.86 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>