More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0093 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  41.94 
 
 		 291 aa  192  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  44.91 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  39.86 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  39.13 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  39.13 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  38.3 
 
 		 434 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  41.79 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  38.1 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  31.7 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  32.33 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  31.91 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  36.49 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  33.33 
 
 		 298 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  32.35 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.04 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  32.95 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  33.08 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  35.34 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  33.82 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  31.09 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  32.71 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.88 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  32.71 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  29.89 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  27.41 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  35.75 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  30.11 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.54 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  33.98 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  31.72 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  28.83 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  33.09 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  29.45 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  35.71 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  32.7 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  34.7 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.9 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  35.27 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  28.67 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  31.8 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.67 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  27.17 
 
 		 292 aa  92.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  28.47 
 
 		 294 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  33.46 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  33.46 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.24 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  29.29 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  34.39 
 
 		 280 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  29.3 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  32 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.04 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  32.2 
 
 		 310 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  30.96 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  30.6 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.08 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  30.18 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  31.48 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  28.57 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  29.43 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  27.5 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  27.95 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  28.37 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  29.12 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  32.98 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  28.87 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  31.73 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  28.57 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  28.62 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  24.23 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.4 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.87 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  27.74 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  28.52 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  24.49 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.72 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  24.38 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  25.09 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  30.07 
 
 		 309 aa  72  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  27.05 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  26.87 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  26.3 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  30.51 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  30.88 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1166  hypothetical protein  26.5 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22916  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  30.61 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  28.28 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  32.3 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  25.56 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  29.03 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  29.1 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  25.72 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  30.72 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  27.5 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  28.28 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.02 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  27.21 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  32.42 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  30.32 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>