234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4824 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  100 
 
 
276 aa  563  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  52.59 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  50.37 
 
 
278 aa  298  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  51.67 
 
 
279 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  49.44 
 
 
291 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  48.88 
 
 
294 aa  278  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  49.45 
 
 
279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  48.9 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  45.79 
 
 
279 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  47.97 
 
 
276 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  49.08 
 
 
274 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  46.84 
 
 
274 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  49.07 
 
 
274 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  49.07 
 
 
274 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  42.47 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  43.28 
 
 
272 aa  235  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  39.56 
 
 
285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.7 
 
 
276 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  40.86 
 
 
279 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  39.03 
 
 
268 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  34.78 
 
 
298 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  35.74 
 
 
277 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  35.87 
 
 
283 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  34.27 
 
 
287 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2405  NmrA family protein  42.79 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  32.16 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  34.04 
 
 
276 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  33.83 
 
 
278 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  32.7 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  29.72 
 
 
284 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  32.83 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  30.25 
 
 
288 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  32.75 
 
 
273 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  30.14 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  26.16 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  27.46 
 
 
434 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  26.16 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  26.95 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  28.77 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  26.62 
 
 
351 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  26.57 
 
 
291 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  29.33 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  26.95 
 
 
277 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  24.73 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.4 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  27.41 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  27.46 
 
 
291 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  25 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  26.95 
 
 
294 aa  89  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  26.06 
 
 
279 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  26.52 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  26.9 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  23.39 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  25.68 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24.31 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  25.44 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  26.1 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  26.46 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  25.35 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  26.71 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  25.64 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  25 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  25.44 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  26.87 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  27.55 
 
 
250 aa  79  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  25.36 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  26.74 
 
 
584 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  23.65 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  23.89 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  22.84 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  25.99 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  26.98 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  23.47 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  26.8 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  22.34 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  28.57 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  24.04 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  26.32 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  25.53 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  26.04 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  25.09 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  24.38 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  25.45 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  26.22 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  23.47 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  26 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  25.18 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  28.09 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  21.88 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  27.81 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  30.2 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  22.45 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  23.83 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  28.32 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  27.33 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  25.63 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  22.81 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  28.67 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>