More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0403 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  100 
 
 
287 aa  567  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  74.29 
 
 
281 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  47.67 
 
 
298 aa  231  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  43.51 
 
 
278 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  43.93 
 
 
279 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  44.8 
 
 
279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  44.06 
 
 
294 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  49.3 
 
 
279 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  41.7 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  44.95 
 
 
283 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  42.7 
 
 
276 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  41.49 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  41.2 
 
 
279 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  42.55 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  38.64 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  41.64 
 
 
274 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  46.4 
 
 
278 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  39.26 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  36.96 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.65 
 
 
279 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  34.27 
 
 
276 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  39.5 
 
 
274 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  38.33 
 
 
276 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.76 
 
 
276 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  40.21 
 
 
274 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  40.21 
 
 
274 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  41.35 
 
 
276 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  38.71 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  39.93 
 
 
268 aa  145  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  34.38 
 
 
351 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  37.59 
 
 
280 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  35.13 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  34.07 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  37.1 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  37.1 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  34.51 
 
 
434 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  35.23 
 
 
284 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  35.05 
 
 
291 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  35.82 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  32.27 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.53 
 
 
283 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  33.33 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  35.52 
 
 
274 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  31.96 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  34.92 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  26.84 
 
 
273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  32.87 
 
 
306 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  29.43 
 
 
292 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2405  NmrA family protein  39.06 
 
 
253 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  31.38 
 
 
291 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  31.47 
 
 
285 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  31.91 
 
 
281 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 
270 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  33.21 
 
 
280 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  36.43 
 
 
279 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  30.82 
 
 
310 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  32.98 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  35.76 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  34.62 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  34.64 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  34.41 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  31.9 
 
 
281 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  29.97 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  27.95 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  36.16 
 
 
240 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  32.42 
 
 
284 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  35.62 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.98 
 
 
271 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  31.94 
 
 
276 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  32.88 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  30.96 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  30.64 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  37.27 
 
 
280 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  34.18 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.27 
 
 
274 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  32.04 
 
 
584 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  33.45 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  31.36 
 
 
274 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  34.3 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  31.05 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  38.04 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  28.28 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  30.2 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  31.4 
 
 
274 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  30.85 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  32.27 
 
 
280 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  31.85 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  29.73 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  30.88 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  28.57 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  31.07 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  30.21 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.17 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.45 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  27.24 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  31.19 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  31.64 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  30.58 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  31.1 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  29.76 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>