More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3559 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  100 
 
 
283 aa  571  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  45.07 
 
 
281 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  45.52 
 
 
288 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  44.68 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  40.89 
 
 
274 aa  198  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  43.26 
 
 
584 aa  198  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  42.31 
 
 
287 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  43.4 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  38.83 
 
 
273 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  42.27 
 
 
280 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  39.72 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  39.19 
 
 
286 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  39.58 
 
 
280 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  43.26 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  43.33 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  37.98 
 
 
274 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  40.28 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  38.06 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  39.79 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  38.54 
 
 
284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  40.14 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  39.37 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  35.74 
 
 
273 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  38.68 
 
 
280 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  36.17 
 
 
282 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  36.36 
 
 
271 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  35.84 
 
 
274 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  37.46 
 
 
310 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  38.3 
 
 
281 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  36.49 
 
 
276 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  37.85 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  36.59 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  36.56 
 
 
283 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  39.72 
 
 
274 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  36.43 
 
 
296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  38.46 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  36.43 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  37.11 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  35.62 
 
 
291 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  33.33 
 
 
277 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  34.48 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  39.71 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  34.07 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.99 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  33.57 
 
 
288 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  32.73 
 
 
273 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  29.72 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  35.13 
 
 
281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  29.9 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  34.64 
 
 
287 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  33.45 
 
 
281 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  32.86 
 
 
291 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4330  NmrA family protein  35.74 
 
 
318 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  31.6 
 
 
434 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.93 
 
 
283 aa  102  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  36.56 
 
 
287 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  31.91 
 
 
299 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  32.89 
 
 
289 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  33.99 
 
 
302 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  31.71 
 
 
285 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  36.09 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  35.43 
 
 
290 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  31.43 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  34.98 
 
 
290 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  31.47 
 
 
298 aa  95.5  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  34.8 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  30.88 
 
 
294 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  32.67 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  32.2 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  32.2 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  30.21 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.64 
 
 
279 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  34.8 
 
 
287 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  29.49 
 
 
291 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  35.71 
 
 
292 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  34.01 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  30.14 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  30.9 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.25 
 
 
351 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  32.18 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  31.94 
 
 
285 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  30.39 
 
 
309 aa  89.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  33.92 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  31.35 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  30.04 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  33.76 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  31.4 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  29.43 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  29.86 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  28.01 
 
 
297 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  29.43 
 
 
284 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  31.9 
 
 
285 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  31.82 
 
 
276 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  31.45 
 
 
280 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  30.1 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  31.77 
 
 
293 aa  85.5  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  28.42 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  26.32 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  32.53 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>