More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5809 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  100 
 
 
279 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  40.65 
 
 
268 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  38.62 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  39.93 
 
 
281 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  39.79 
 
 
283 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  38.35 
 
 
584 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  38.57 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  36.36 
 
 
281 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  41.7 
 
 
272 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  36.84 
 
 
280 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  37.59 
 
 
279 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  38.23 
 
 
273 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  41.43 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  36.97 
 
 
284 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  35.29 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  38.27 
 
 
280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  32.86 
 
 
274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  35.64 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  35.82 
 
 
279 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  35.14 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  32.63 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  32.88 
 
 
274 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  42.25 
 
 
279 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.29 
 
 
274 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  34.11 
 
 
286 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  36.04 
 
 
283 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  31.1 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  38.62 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  34.75 
 
 
280 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  34.48 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  36.33 
 
 
280 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  34.72 
 
 
310 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  33.33 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  34.3 
 
 
281 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  35.02 
 
 
288 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  34.89 
 
 
274 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  34.64 
 
 
299 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  34.55 
 
 
269 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  33.57 
 
 
434 aa  96.3  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  33.93 
 
 
281 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  31.49 
 
 
291 aa  95.5  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  33.09 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  35.62 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  32.53 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  31.56 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  31.47 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.02 
 
 
273 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  33.66 
 
 
302 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  32.03 
 
 
298 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  33.1 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  32.75 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  26.9 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  31.16 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  29.69 
 
 
288 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  33.68 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  30.04 
 
 
280 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  30.82 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  33.45 
 
 
288 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  32.39 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  31.75 
 
 
294 aa  85.5  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  31 
 
 
295 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  30.91 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  31.49 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  30 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  28.18 
 
 
281 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  30.69 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  31.87 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  29.75 
 
 
351 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  29.01 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  29.31 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  32.14 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  32.06 
 
 
281 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  29.14 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  28.17 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  31.88 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  30.1 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  30.38 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  30.6 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.92 
 
 
287 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  33.49 
 
 
290 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  33.01 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  30.91 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  32.65 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.97 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  31.91 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  31.01 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.72 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  32.53 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.73 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  31.1 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  31.1 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  27.59 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  33.45 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  32.39 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  30.45 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  28.03 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1166  hypothetical protein  28.71 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22916  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  30.96 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>