More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1339 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  100 
 
 		 274 aa  552  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  55.23 
 
 		 280 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  50.91 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  50.73 
 
 		 274 aa  251  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  44.53 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  46.18 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  46.38 
 
 		 274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  47.25 
 
 		 280 aa  218  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  41.01 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  37.54 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  35.07 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  36.88 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  33.45 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  34.55 
 
 		 584 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  40.28 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  34.51 
 
 		 280 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  37.06 
 
 		 272 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  35.07 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  34.51 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  32.62 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  35.84 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  33.8 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.91 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  36.3 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  33.1 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  37.67 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  32.99 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  32.88 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.54 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  33.8 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  37.21 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  30.14 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  32.85 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  30.04 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  32.51 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4330  NmrA family protein  30.27 
 
 		 318 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  31.12 
 
 		 288 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  33.33 
 
 		 287 aa  98.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  26.43 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  30.48 
 
 		 288 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  32.97 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  31.49 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  29.53 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  31.14 
 
 		 281 aa  95.5  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  29.75 
 
 		 294 aa  95.5  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  28.24 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  31.17 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  26.41 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  28.92 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  26.94 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  29.39 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  32.43 
 
 		 293 aa  89.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  32.37 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  32.37 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  28.62 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  32.04 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  31.4 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  32.37 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.25 
 
 		 290 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.25 
 
 		 290 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  30.14 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  31.43 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  26.64 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  29.6 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  29.05 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  25.35 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  28.57 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  28.01 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  29.79 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  26.98 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  27.3 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  29.74 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  26.12 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  25.51 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  26.34 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  30.77 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  27.34 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  29.47 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000606737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.19 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  31.36 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  29.24 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  26.86 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  25.83 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  24.73 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.71 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  24.48 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  27.56 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  27.18 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  23.45 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  24.04 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  26 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  26.46 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>