More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0272 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  100 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  61.73 
 
 		 271 aa  323  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  56.07 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  55 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  57.19 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  40.64 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  39.35 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  39.79 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  37.32 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  37.98 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  35.74 
 
 		 584 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  34.55 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  36.46 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  35.74 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.82 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  38.18 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  38.38 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  32.62 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  35.09 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  35.02 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  36.56 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  36.17 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  35.36 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  32.86 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  36.69 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  37.28 
 
 		 295 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  35.46 
 
 		 310 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  34.98 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  36 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  35.27 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  35.97 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  37.85 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  30.71 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  33.81 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  33.1 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  35.57 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  31.14 
 
 		 287 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.63 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  32.75 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  34.77 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  29.74 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  29.89 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  29.76 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  33.45 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  32.85 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  36.69 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  31.29 
 
 		 351 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  34.3 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  27.52 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  30.88 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  31.91 
 
 		 282 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4330  NmrA family protein  32.19 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  30.95 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  31.41 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  32.37 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.32 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  28.42 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  31.16 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  29.58 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  28.52 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  29.82 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  29.27 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  32.53 
 
 		 285 aa  88.6  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  31.05 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  29.21 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  32.17 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  26.99 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  26.99 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  25.34 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  28.16 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.15 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  28.32 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  30.69 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  30.04 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  26.04 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  28.37 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  33.57 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  25.44 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  30.36 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  30.09 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  29.09 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  30.09 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  28.57 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  31.67 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  28.45 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  29.49 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  29.86 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  30.63 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.38 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  26.46 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  29.57 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  26.01 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  28.62 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  31.03 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00992  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01860)  26.26 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.961582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  28.88 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  31.12 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  27.64 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>