260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5615 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  100 
 
 		 292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  53.56 
 
 		 297 aa  311  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  48.99 
 
 		 308 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  51.54 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  50.68 
 
 		 294 aa  290  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  48.83 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  45.89 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  46.98 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  46.23 
 
 		 291 aa  261  8e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  51.02 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  43.88 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  43.13 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  44.56 
 
 		 295 aa  241  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  38.57 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0241  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.11 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  29.89 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  30.5 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.86 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  32 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.57 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  28.91 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  29.34 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  24.65 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  29.27 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  23.11 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.57 
 
 		 281 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  27.89 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  29.1 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  29.39 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  23.53 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  30 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  26.85 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  29.68 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  25.45 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  29.6 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  27.62 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.26 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  28.14 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  27.02 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  25.59 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.41 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  27.35 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  27.35 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  28.06 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  28.62 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1014  NmrA-like  26.13 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.552271  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  22.84 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  25.83 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  26.89 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  26.92 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  24.72 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.23 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  30.41 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  27.94 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  27.37 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  27.86 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  27.07 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2579  NmrA family protein  26.59 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2980  NmrA-like protein  26.42 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  25.34 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4112  NmrA family protein  25.34 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.864196  normal  0.177288 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  24.91 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  29.26 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.32 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  29.41 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  25.61 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  28.85 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  27.94 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  25.64 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  29.47 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  29.47 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  27.53 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  29.32 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  32 
 
 		 137 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  26.57 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  25.97 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  25.97 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  26.46 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  27.31 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  26.64 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  26.34 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  24.49 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  27.89 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  23.62 
 
 		 584 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  26.92 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.37 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 		 478 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  24.59 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.52 
 
 		 196 aa  53.9  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  23.53 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1843  NmrA family protein  26.23 
 
 		 124 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  25.83 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>