177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4691 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  100 
 
 
308 aa  633  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  54.58 
 
 
297 aa  326  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  50.67 
 
 
301 aa  316  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  50.17 
 
 
299 aa  305  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  48.99 
 
 
292 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  52.03 
 
 
294 aa  293  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  48.29 
 
 
294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  45.3 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2088  hypothetical protein  47.67 
 
 
296 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1768  NmrA family protein  43.22 
 
 
305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4345  NmrA family protein  40.2 
 
 
295 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  hitchhiker  0.00424146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  40.53 
 
 
319 aa  226  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  38.93 
 
 
295 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  38.26 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0241  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.25 
 
 
292 aa  169  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2334  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.95 
 
 
312 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1503  NmrA-like  29.82 
 
 
312 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  27.21 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.11 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  30.18 
 
 
294 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  24.44 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.46 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  24.19 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  26.62 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4046  NmrA family protein  26.84 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  27.55 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5835  NmrA family protein  25.11 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  22.93 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  23.57 
 
 
584 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2165  NmrA family protein  25.09 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  0.071743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  26.72 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  27.68 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  24.66 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  24.22 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  26.55 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  29.12 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  25.1 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  26.22 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  26.55 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  24.34 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  23.6 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  23.91 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  23.96 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  26.13 
 
 
288 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  28.14 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  26.96 
 
 
279 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  24.13 
 
 
293 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  26.17 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  22.76 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  25.7 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  25.7 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5092  NmrA family protein  25.83 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.503055  normal  0.243212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  25.45 
 
 
280 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  24.5 
 
 
288 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
314 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  26.87 
 
 
291 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  24.91 
 
 
272 aa  58.9  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  25.13 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  24.05 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  24.14 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4977  NmrA family protein  23.01 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656946  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  23.3 
 
 
287 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  24.9 
 
 
274 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  24.57 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  23.4 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09194  conserved hypothetical protein  25.76 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.947988  normal  0.455195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  21.71 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  24.68 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  25.55 
 
 
268 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1674  hypothetical protein  22.66 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  23.56 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  26.41 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  26.45 
 
 
293 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
321 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5094  NmrA family protein  23.68 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.287855 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  24.17 
 
 
381 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  26.38 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  27.83 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  22.12 
 
 
321 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  25.42 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3245  NmrA family protein  22.93 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.41967 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2209  hypothetical protein  29.71 
 
 
514 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  35.29 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  36.25 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
324 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  21.29 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.13 
 
 
477 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.13 
 
 
477 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
325 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.13 
 
 
477 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0239  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.36 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000144523  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  23.71 
 
 
300 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  21.93 
 
 
294 aa  49.3  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  25.11 
 
 
292 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>