211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0880 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2535  hypothetical protein  52.02 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  46.54 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  47.69 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.32 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.52 
 
 		 238 aa  164  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.114154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  45.66 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2363  putative NADH-flavin reductase-like protein  43.89 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0323  NmrA family protein  41.67 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413807  normal  0.0951246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  37.9 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.81 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.39 
 
 		 204 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8730  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase protein  39.45 
 
 		 202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  36.41 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0976  TrkA domain-containing protein  38.12 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.803978  decreased coverage  0.00042868 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 203 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1088  hypothetical protein  37.67 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  35.62 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  35.75 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  35.62 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  33.03 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.65 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  33.03 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0392  hypothetical protein  40.54 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383752  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  34.55 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  34.1 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0220  hypothetical protein  35.29 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  36.07 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 		 204 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2862  putative NADH-flavin reductase protein  36.49 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  33.78 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4751  hypothetical protein  35.45 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  32.73 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  32.74 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0802  hypothetical protein  30.3 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.971271  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.7 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  35.91 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  30.94 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4261  hypothetical protein  34.84 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  32.43 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 		 214 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  32.46 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.79 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4152  hypothetical protein  30.45 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000014764  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884216  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.02 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00404  hypothetical protein  33.18 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000519632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.02 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26050  putative NADH-flavin reductase  33.33 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.600707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.84 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0670  hypothetical protein  29.07 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.84049e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  31.53 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0768  putative NADH-flavin reductase  34.39 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  31.07 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0041  hypothetical protein  31.25 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000214852  hitchhiker  2.07988e-18 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  30.6 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3985  hypothetical protein  35.14 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  30.8 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4926  hypothetical protein  30.26 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000966245  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5302  hypothetical protein  30.26 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4789  hypothetical protein  30.7 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000718942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0824  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  31.11 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4769  hypothetical protein  30.7 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.03269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  34.42 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5170  hypothetical protein  30.7 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7194299999999997e-45 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1266  hypothetical protein  30.34 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0147232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4887  hypothetical protein  30.26 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>