128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1538 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.114154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  46.52 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2535  hypothetical protein  41.67 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2363  putative NADH-flavin reductase-like protein  40.36 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.94 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  38.94 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  34.7 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  33.63 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0976  TrkA domain-containing protein  35 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.803978  decreased coverage  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1088  hypothetical protein  35.32 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  30.49 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  30.49 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.24 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  29.22 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  29.22 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  31.31 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  29.6 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0220  hypothetical protein  27.98 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000163104  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1225  YwnB  23.04 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0392  hypothetical protein  31.86 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383752  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  26.22 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4261  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0670  hypothetical protein  23.61 
 
 		 211 aa  62  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.84049e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4926  hypothetical protein  27.78 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000966245  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5302  hypothetical protein  27.78 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4152  hypothetical protein  27.68 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  27.78 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0802  hypothetical protein  23.15 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.971271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  29.17 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  28.63 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8730  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase protein  29.11 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4789  hypothetical protein  28.7 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000718942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0041  hypothetical protein  28.7 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000214852  hitchhiker  2.07988e-18 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  29.58 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4769  hypothetical protein  28.7 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.03269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  25.99 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4887  hypothetical protein  28.7 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5170  hypothetical protein  28.7 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7194299999999997e-45 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  26.13 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  28.7 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  29.3 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4751  hypothetical protein  28.7 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  26.27 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  27.44 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  31.09 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  27.1 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  26.11 
 
 		 202 aa  52.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.76 
 
 		 494 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  29.13 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.48 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2862  putative NADH-flavin reductase protein  28.3 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884216  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3985  hypothetical protein  30.28 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000014764  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  22.36 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26050  putative NADH-flavin reductase  24.89 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.600707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  25.94 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.57 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.04 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  28.04 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  29.29 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1266  hypothetical protein  28.16 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0147232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.11 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  27.57 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0694  hypothetical protein  27.57 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00014158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  27.57 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>