78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2363 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2363  putative NADH-flavin reductase-like protein  100 
 
 		 380 aa  738    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  43.89 
 
 		 223 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 		 238 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.114154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2535  hypothetical protein  35.43 
 
 		 217 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 		 208 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  36.28 
 
 		 206 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0976  TrkA domain-containing protein  34.45 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.803978  decreased coverage  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  34.39 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  33.02 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1088  hypothetical protein  31.65 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  29.41 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 		 216 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  28.31 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  30.06 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4926  hypothetical protein  30.06 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000966245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  30.06 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5302  hypothetical protein  30.06 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154626  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0220  hypothetical protein  26.51 
 
 		 211 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000163104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4887  hypothetical protein  30.06 
 
 		 212 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4789  hypothetical protein  29.48 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000718942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0041  hypothetical protein  29.48 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000214852  hitchhiker  2.07988e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  30.72 
 
 		 211 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5170  hypothetical protein  29.48 
 
 		 212 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7194299999999997e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4769  hypothetical protein  29.48 
 
 		 212 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.03269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 		 213 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  29.48 
 
 		 212 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  30.12 
 
 		 211 aa  53.1  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 		 203 aa  53.1  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4751  hypothetical protein  30.91 
 
 		 215 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0392  hypothetical protein  34.3 
 
 		 213 aa  52.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383752  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1744  putative NADH-flavin reductase  28.05 
 
 		 216 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 		 204 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 204 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 		 210 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0768  putative NADH-flavin reductase  30.54 
 
 		 210 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 214 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  29.27 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4261  hypothetical protein  36.09 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  29.94 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  31.1 
 
 		 203 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 		 210 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 		 223 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.11 
 
 		 213 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0670  hypothetical protein  25.11 
 
 		 211 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.84049e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0802  hypothetical protein  24.88 
 
 		 211 aa  46.6  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.971271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 		 218 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8730  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase protein  29.25 
 
 		 202 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  28.24 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 204 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  26.04 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 		 203 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1225  YwnB  24.43 
 
 		 211 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6315  NmrA family protein  37.14 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  28.82 
 
 		 202 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.58 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 		 210 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 		 210 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 		 205 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 212 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.44 
 
 		 286 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  31.61 
 
 		 332 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  26.71 
 
 		 203 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 200 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 		 211 aa  43.1  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.89 
 
 		 213 aa  43.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26050  putative NADH-flavin reductase  29.73 
 
 		 210 aa  43.1  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.600707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.4 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>