112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1744 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1744  putative NADH-flavin reductase  100 
 
 
216 aa  440  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0749  putative NADH-flavin reductase  50.7 
 
 
218 aa  221  8e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0164  dihydrodipicolinate reductase  48.84 
 
 
216 aa  211  5.999999999999999e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0025  putative NADH-flavin reductase  47.44 
 
 
215 aa  204  9e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0898967  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0041  hypothetical protein  37.85 
 
 
212 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000214852  hitchhiker  2.07988e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  37.85 
 
 
212 aa  134  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4926  hypothetical protein  37.38 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000966245  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5302  hypothetical protein  37.38 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4769  hypothetical protein  37.38 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.03269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  37.38 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4887  hypothetical protein  37.85 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  37.38 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5170  hypothetical protein  37.38 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7194299999999997e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  37.38 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4789  hypothetical protein  36.92 
 
 
212 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000718942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0220  hypothetical protein  36.57 
 
 
211 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000163104  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0670  hypothetical protein  37.13 
 
 
211 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.84049e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26050  putative NADH-flavin reductase  37.21 
 
 
210 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.600707  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0802  hypothetical protein  33.49 
 
 
211 aa  98.6  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.971271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 
204 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
213 aa  91.3  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  33.64 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1225  YwnB  27.44 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.88 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
204 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.82 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0976  TrkA domain-containing protein  34.1 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.803978  decreased coverage  0.00042868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  30.14 
 
 
213 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0392  hypothetical protein  28.44 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383752  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273763  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  30.8 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00404  hypothetical protein  30.99 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000519632  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  29.91 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1088  hypothetical protein  33.49 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  27.91 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  27.93 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  29.03 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  30.56 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4261  hypothetical protein  31.84 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  32.24 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1541  hypothetical protein  26.73 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000965816  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8730  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase protein  32.43 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  30.7 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0848  putative NADH-flavin reductase  31.63 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000130778  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  30.28 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.31 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4152  hypothetical protein  27.91 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  28.51 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
215 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  28.96 
 
 
216 aa  61.6  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  29.09 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1266  hypothetical protein  30.51 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0147232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0824  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2862  putative NADH-flavin reductase protein  27.54 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
215 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
207 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0768  putative NADH-flavin reductase  28.89 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427063  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0849  hypothetical protein  33.08 
 
 
132 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2892  putative NADH-flavin reductase  25.69 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  25.58 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  28.44 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.3 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  28.3 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2535  hypothetical protein  26.7 
 
 
217 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  28.3 
 
 
213 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0694  hypothetical protein  28.3 
 
 
213 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00014158  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
223 aa  52  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  28.3 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  28.3 
 
 
240 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  28.3 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  27.73 
 
 
215 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>