103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0164 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0164  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0025  putative NADH-flavin reductase  64.49 
 
 		 215 aa  291  4e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0898967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1744  putative NADH-flavin reductase  48.84 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0749  putative NADH-flavin reductase  42.13 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4769  hypothetical protein  35.98 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.03269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5170  hypothetical protein  35.98 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7194299999999997e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0041  hypothetical protein  35.98 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000214852  hitchhiker  2.07988e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  35.51 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4887  hypothetical protein  35.98 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4789  hypothetical protein  35.51 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000718942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  35.51 
 
 		 212 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4926  hypothetical protein  35.05 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000966245  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5302  hypothetical protein  35.05 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  35.05 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  35.81 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0670  hypothetical protein  32.86 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.84049e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26050  putative NADH-flavin reductase  31.94 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.600707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1225  YwnB  28.37 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0220  hypothetical protein  30.56 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000163104  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0802  hypothetical protein  27.31 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.971271  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  29.09 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1541  hypothetical protein  28.97 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000965816  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  31.34 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  27.73 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.16 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  31.16 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0694  hypothetical protein  31.16 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00014158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  31.31 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  31.16 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  31.16 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  31.16 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  28.18 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8730  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase protein  31.08 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  27.15 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  27.73 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  29.77 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  29.91 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0392  hypothetical protein  26.61 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383752  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.15 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0848  putative NADH-flavin reductase  28 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000130778  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  28.64 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  31.82 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  28.24 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  27.8 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  29.3 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884216  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  26.94 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  29.55 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000014764  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.73 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0824  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00404  hypothetical protein  27.36 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000519632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2862  putative NADH-flavin reductase protein  25.37 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4261  hypothetical protein  27.98 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  28.44 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0849  hypothetical protein  25.95 
 
 		 132 aa  50.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0976  TrkA domain-containing protein  27.7 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.803978  decreased coverage  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2892  putative NADH-flavin reductase  24.32 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  23.5 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  28.38 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3985  hypothetical protein  29.85 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>