More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3281 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  35.05 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  38.14 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.02 
 
 		 213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  36.62 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  34.72 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  34.58 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  35.51 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  31.46 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  36.68 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  31.84 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  33.81 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.61 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 		 223 aa  94.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  31.96 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  32.71 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  35.4 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  30.19 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  29.82 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  31.31 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  29.82 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  29.82 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  29.82 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  29.36 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  28.04 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  30.66 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  30.66 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  30.66 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  30.19 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  29.11 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  31.31 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  28.7 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  29.82 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  28.9 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.43 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  29.17 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  28.11 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  28.11 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  29.41 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2862  putative NADH-flavin reductase protein  27.52 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  26.94 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  30.95 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  28.96 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  29.58 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  30.05 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  33 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  29.5 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  24.89 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  30.19 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.44 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  29 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000014764  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.55 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  27.01 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  28.65 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  29.7 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  33.02 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  29.76 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  30.46 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  26.03 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  26.03 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  32.75 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  25.96 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.15 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  33.02 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  35.19 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.33 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  26.48 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  25.57 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>