86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3771 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 208 aa  423  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  57 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.97 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 		 213 aa  97.8  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  27.23 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  28.7 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  28.5 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  26.5 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  28.44 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  28.44 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  28.44 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  28.44 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  28.44 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  28.06 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  24.66 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  25.48 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  27.96 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  24.88 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  26.85 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  23.47 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  26.46 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  23.15 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  23.98 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  26.34 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  25.45 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  24.77 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.58 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  25.35 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  25.35 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  25.35 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  24.77 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  26.92 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  26.29 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  25.35 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  26.21 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  25.23 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.9 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2134  hypothetical protein  24.26 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  25.84 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  25.73 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.56 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.9 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.86 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  24.32 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  21.56 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4907  hypothetical protein  20.87 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1448  hypothetical protein  23.11 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  24.42 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.74 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  25.64 
 
 		 267 aa  45.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  22.22 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  26.83 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  32.56 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  23.64 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.67 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44077  predicted protein  25.7 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00404  hypothetical protein  22.43 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000519632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  24.09 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.15 
 
 		 203 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  25.55 
 
 		 211 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.33 
 
 		 214 aa  42  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.87 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  25.47 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  23.62 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>