More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26382 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.52 
 
 		 228 aa  175  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.34 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  45.6 
 
 		 210 aa  149  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  35.61 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.48 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.75 
 
 		 223 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 		 212 aa  99.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  34.15 
 
 		 223 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  34.72 
 
 		 207 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.44 
 
 		 205 aa  95.5  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  36.41 
 
 		 224 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  36.41 
 
 		 216 aa  92.8  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  34.26 
 
 		 207 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  32.57 
 
 		 216 aa  92  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  32.57 
 
 		 216 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  32.57 
 
 		 216 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  31.13 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  33.96 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 		 219 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  30.62 
 
 		 209 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  30.62 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  34.2 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  30.48 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  30.45 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  31.16 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.24 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  33.04 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  33.18 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  26.54 
 
 		 211 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  29.33 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  35.26 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  28.51 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  32.55 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  28 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  27.39 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 232 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  29.33 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  26.91 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  26.91 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  28.89 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  26.96 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  26.67 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  26.32 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  28.44 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  29.17 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  30.52 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  28.31 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  28.51 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.48 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  36.52 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  32.74 
 
 		 214 aa  62  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.65 
 
 		 211 aa  62  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  30.66 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  27.32 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  28.45 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  27.14 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  28.45 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  27.04 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  28.79 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  28.79 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  26.05 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.79 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  30.3 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  29.41 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>