More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2191 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  100 
 
 
210 aa  411  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  42.79 
 
 
213 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  36.32 
 
 
211 aa  126  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  36.79 
 
 
209 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  36.24 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  37.13 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  35.89 
 
 
231 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00190  hypothetical protein  31.18 
 
 
255 aa  87  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  36.18 
 
 
202 aa  84.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  33.02 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  24.3 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10896  conserved hypothetical protein  30.7 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.43 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  39.77 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.85 
 
 
231 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  22.01 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  33.52 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  22.01 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  22.01 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  22.01 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  22.01 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  22.01 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  27.8 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  42.72 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  28.83 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  28.24 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  33.5 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  39.42 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  28.66 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.24 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  28.22 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  25.6 
 
 
214 aa  62  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  28.57 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  38.46 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 
298 aa  61.6  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  28.66 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  27.62 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  28.21 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  28.85 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  32.1 
 
 
320 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  28.11 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  28.66 
 
 
206 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  28.66 
 
 
206 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  28.66 
 
 
206 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.25 
 
 
196 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
204 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  36.7 
 
 
223 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  26.34 
 
 
282 aa  58.2  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  35.9 
 
 
274 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  36.36 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  40.59 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
223 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  34.95 
 
 
271 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  40.3 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
301 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
213 aa  55.1  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  31.61 
 
 
204 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  43.84 
 
 
213 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  31.65 
 
 
327 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.44 
 
 
330 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  30.91 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.67 
 
 
332 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.33 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0189126  hitchhiker  0.0000000628331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  30.56 
 
 
285 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.67 
 
 
332 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.33 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.67 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
291 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  31.48 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
215 aa  52  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1266  hypothetical protein  40 
 
 
233 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0147232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
210 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17440  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.5 
 
 
330 aa  52  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147754  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
210 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  34.51 
 
 
680 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
306 aa  51.6  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
347 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>