229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2182 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  42.79 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  36.62 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  35.85 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  38.55 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  25.59 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  25.93 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  25.93 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  25.93 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  27.6 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  25.46 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  25.46 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  25.46 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  30.7 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.41 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  30.19 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  33.49 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  32.64 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  22.62 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  31.63 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  32.08 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10896  conserved hypothetical protein  31.52 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  32.08 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  29.72 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  33.74 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  32.08 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  29.58 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  37.06 
 
 		 680 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  29.11 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.35 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  29.11 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  29.11 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  29.11 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.27 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  29.75 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00190  hypothetical protein  26.83 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  41.18 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  29.26 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.49 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.91 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  25.66 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  28.9 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  28.57 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.89 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  25.32 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  28.72 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.53 
 
 		 327 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.56 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000014764  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  30 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  31.72 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.75 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0189126  hitchhiker  0.0000000628331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  27.72 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  26.85 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.75 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  38.75 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  38.75 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  37.65 
 
 		 351 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  41.56 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  38.75 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0694  hypothetical protein  38.75 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00014158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  32.26 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  30.89 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  29.33 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.75 
 
 		 357 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.56 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2862  putative NADH-flavin reductase protein  42.86 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0670  hypothetical protein  25.35 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.84049e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  33.33 
 
 		 315 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>