236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3536 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
219 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.68 
 
 
218 aa  271  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  68.06 
 
 
219 aa  262  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  64.62 
 
 
214 aa  262  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  57.21 
 
 
215 aa  226  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  55.56 
 
 
215 aa  225  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.6 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  56.16 
 
 
221 aa  209  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  47.56 
 
 
227 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.04 
 
 
227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.17 
 
 
222 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  41.74 
 
 
219 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  43.44 
 
 
229 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.79 
 
 
218 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  44.34 
 
 
216 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.66 
 
 
219 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.66 
 
 
219 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.66 
 
 
219 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.09 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  36.87 
 
 
218 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.57 
 
 
218 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.78 
 
 
211 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.84 
 
 
216 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.17 
 
 
230 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.73 
 
 
213 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  35.78 
 
 
218 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.35 
 
 
222 aa  131  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  43.78 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.25 
 
 
221 aa  128  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.4 
 
 
218 aa  127  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  40.09 
 
 
214 aa  125  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  31.34 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  34.8 
 
 
280 aa  111  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 
212 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
231 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  30.14 
 
 
212 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
213 aa  105  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 
219 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.94 
 
 
210 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  41.94 
 
 
219 aa  101  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  29.58 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  29.58 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.94 
 
 
230 aa  95.5  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
212 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.53 
 
 
211 aa  89  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  32.26 
 
 
209 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.73 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  30.73 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  30.73 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  34.45 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  29.11 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.23 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  30.26 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  28.64 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  31.05 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  26.63 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745456  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  28.5 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  27.89 
 
 
255 aa  62  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.5 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  27.6 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  25.12 
 
 
228 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  25.76 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  28.91 
 
 
227 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  26.83 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  31.91 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
306 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  30.63 
 
 
246 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
309 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
310 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.03 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  26.57 
 
 
207 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 
308 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  26.57 
 
 
207 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  30.88 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
307 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
219 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.33 
 
 
320 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
307 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.41 
 
 
320 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.67 
 
 
320 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>