86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2134 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2134  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4907  hypothetical protein  59.59 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.5 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  34.48 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.86 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  25.6 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  32.18 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  34.5 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.26 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  26.37 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.14 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  39.36 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.33 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.9 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 479 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.79 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  44.16 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  38.2 
 
 		 342 aa  48.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  38.1 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  37.5 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  33.33 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  37.23 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0694  hypothetical protein  37.23 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00014158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2621  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.5 
 
 		 496 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 		 496 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.23 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  37.23 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  36.67 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  36.67 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 		 327 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  25.55 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  31.91 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 		 476 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2462  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 		 476 aa  45.1  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 476 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.489378  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0898  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 		 476 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 476 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1587  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.79 
 
 		 496 aa  45.1  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0973  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 		 476 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0942  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 		 476 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.286438  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 210 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  39.77 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.56 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427063  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00874  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.33 
 
 		 476 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  34.72 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02651  hypothetical protein  29.09 
 
 		 481 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 476 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.47 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  38.57 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  34.78 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0220  hypothetical protein  27.52 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 		 478 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1031  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.51 
 
 		 477 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1000  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.51 
 
 		 477 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  34.04 
 
 		 213 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1266  hypothetical protein  36.11 
 
 		 233 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0147232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  22.17 
 
 		 223 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1088  hypothetical protein  35.24 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 		 242 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.51 
 
 		 477 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.51 
 
 		 477 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 282 aa  42  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  28.38 
 
 		 205 aa  42  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.51 
 
 		 477 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.23 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>