60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0474 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  100 
 
 		 205 aa  413  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 		 212 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  35.94 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  35.55 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  34.6 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  31.31 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  35.55 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 		 194 aa  91.7  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  34.13 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1080  saccharopine dehydrogenase related protein  32.08 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  36.81 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1649  saccharopine dehydrogenase or related protein  28.57 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.72 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  23.53 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.73 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1448  hypothetical protein  31.86 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  27.49 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  25.81 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  27.18 
 
 		 255 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.76 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 		 250 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  25.28 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 		 506 aa  45.1  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  26.24 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  26.18 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.41 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  22.77 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  24.19 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  24.73 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  23.32 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  25 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  21.57 
 
 		 310 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.16 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2096  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.46 
 
 		 314 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644928  hitchhiker  0.0000124933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.14 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 308 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 		 478 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.577692  normal  0.772598 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  25 
 
 		 282 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 		 304 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  23.08 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.11 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.33 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  26.05 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>