135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1795 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  98.11 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  98.11 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  99.32 
 
 		 158 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.55 
 
 		 211 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.72 
 
 		 212 aa  254  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  50.47 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  46.98 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  44.81 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.79 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1080  saccharopine dehydrogenase related protein  38.97 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  95.52 
 
 		 69 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.39 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1649  saccharopine dehydrogenase or related protein  36.02 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  35.55 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2319  hypothetical protein  97.83 
 
 		 60 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.227309  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.46 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  25.37 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  25.37 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  25.37 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  26.11 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  25.24 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  28.48 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  30.19 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  26.24 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  30.19 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  28.75 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  28.48 
 
 		 321 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  27.44 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 		 308 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 309 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  26.92 
 
 		 287 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  26.25 
 
 		 289 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 		 327 aa  52  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  29.22 
 
 		 282 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  29.56 
 
 		 287 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  26.26 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.5 
 
 		 270 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.35 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  26.71 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  27.64 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  25.95 
 
 		 434 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.27 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.94 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  26.92 
 
 		 287 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  28.86 
 
 		 294 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  27.18 
 
 		 291 aa  48.5  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  25.47 
 
 		 290 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  25.79 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  21.43 
 
 		 291 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  21.56 
 
 		 294 aa  48.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  26.8 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  26.8 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.51 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  24.85 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  24.68 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 		 227 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 		 325 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  26.19 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 		 325 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 		 325 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  27.15 
 
 		 285 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  32.08 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  29.41 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  27.89 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  25.64 
 
 		 257 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  29.17 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  29.17 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  25.14 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17427  predicted protein  36 
 
 		 312 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  25.93 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  28.14 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  26.9 
 
 		 274 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  32.08 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 312 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  26.21 
 
 		 281 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 		 347 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  25.58 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  30.7 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>