145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4864 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  99.52 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  58.42 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  55.92 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  55.92 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  55.92 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  56.93 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  40.95 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  45.86 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.46 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 		 225 aa  107  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 		 228 aa  104  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  38.51 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  35.55 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.27 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  34.26 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  36.08 
 
 		 224 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.88 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  29.1 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  25.56 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  25.56 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  30.43 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  28.11 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  25.25 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  27.96 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  35.44 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  28.77 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.07 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  24.64 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  27.01 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  24.3 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  28.3 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.39 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  28.39 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  28.65 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  29.69 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08271  hypothetical protein  41.94 
 
 		 72 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.13 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.93 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  28.65 
 
 		 287 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.47 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  28.57 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  24.36 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  27.12 
 
 		 282 aa  52  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  29.41 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.64 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  27.45 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  29.05 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 		 308 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  32.57 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  29.53 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.94 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  28.77 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  27.21 
 
 		 257 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  26.8 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  27.21 
 
 		 257 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  27.18 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  25.49 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  26.29 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  32.73 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  30 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  27.89 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  28.4 
 
 		 339 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  26.21 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  29.07 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  33.77 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  34.15 
 
 		 284 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  26.8 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 		 301 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  22.8 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  31.61 
 
 		 288 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  23.78 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  25.6 
 
 		 294 aa  45.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  26.25 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  32.99 
 
 		 282 aa  45.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>