112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1014 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.42 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  46.76 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  45.07 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.38 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  44.81 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  44.81 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  43.87 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43 
 
 		 194 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1649  saccharopine dehydrogenase or related protein  33.33 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1080  saccharopine dehydrogenase related protein  32.08 
 
 		 210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  41.22 
 
 		 158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.67 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  34.13 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.73 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  22.82 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  25.25 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  25.25 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  27.78 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  31.89 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  28.18 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  27.22 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  27.67 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  27.67 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  27.85 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  27.85 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  26.63 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  28.3 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  22.97 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  26.63 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  28.57 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  25.25 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  23.15 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  28.12 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  28.75 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  22.89 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.03 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  25.91 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  26.95 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.13 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  25.82 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  26.13 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  26.13 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.79 
 
 		 500 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17427  predicted protein  38.82 
 
 		 312 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  25.91 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  25 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  23.27 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.93 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  25.25 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  25.5 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  25.5 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  25.5 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.56 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.67 
 
 		 491 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.67 
 
 		 491 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  24.15 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  23.62 
 
 		 281 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  23.62 
 
 		 281 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.41 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  25.17 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08611  hypothetical protein  29.66 
 
 		 299 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0698127  hitchhiker  0.000145998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.17 
 
 		 494 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.79 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  28.43 
 
 		 296 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  26.03 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  27.93 
 
 		 282 aa  45.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  24.85 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.28 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  23.04 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.51 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.04 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  25.47 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  25.64 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  25.55 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  25.37 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  25.96 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.61 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  26.32 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.44 
 
 		 358 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.38 
 
 		 270 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>